设计清晰的软件架构进行重构的过程可以分为以下几个步骤：
1.理解业务需求和问题域
在进行软件架构设计之前，首先需要理解业务需求和问题域。这包括将模糊的需求描述转变成清晰的问题域（业务域），梳理出清晰的业务流程，以及列出当前需要解决和未来可能需要解决的问题。通过对业务流程进行分析，可以识别出业务功能，然后将业务流程和业务功能点组合成一张业务功能矩阵图。
2.设计产品架构
产品架构是基于业务架构的业务功能矩阵图进行设计的。它至少分为三层：用户感知层、功能模块层和数据层。在设计产品架构图时，除了表达产品的核心功能外，还需要体现信息流动的路径。如果当前产品的主要使用角色只有一个，可以用箭头表明模块间信息流动的方式即可。如果当前产品涉及的角色比较多，则需要用不用颜色的线条将他们和各个模块之间的信息交互关系表示出来。
3.构建领域模型
领域模型是根据业务流程中的领域对象进行分析得到的。它不仅能清晰地反映企业的业务域，还能清晰地描绘出一幅企业的数据模型。领域模型构建完成后，已经能够初步地掌握整个系统的数据模型。其中，绿色的PartPlaceThingArchetype可以用来表示ER图中的实体模型，红色的MomentIntervalArchetype可以用来表示ER图中的关系。
4.设计应用架构
应用架构是要说明产品架构分哪些应用系统，应用系统间是如何集成的。分布式应用架构是指存在多个系统，系统之间通过接口的形式进行调用，不同系统的数据存储在多个DB里面。那么，按照子系统的边界进行切分，能得到整个产品的子系统组成。当应用内存在几个相对独立的模块，每个模块的业务逻辑差别比较大，且内部的组成较为复杂和庞大时，还需要进一步对应用内进行子系统的切分。
5.考虑重构的方向和方法
在设计软件架构时，需要考虑到重构的方向和方法。例如，新业务持续增加、系统可复用性底、模块或组件中业务边界不明确等问题都可能导致需要进行重构。为了解决这些问题，可以采用大中台战略，实施代码分层设计，使用DDD设计思路，以及合适的设计模式（如MVC、MVCS、MVVM、VIPER）等。
6.实施架构验证
软件架构设计出来之后，要做的事情就是让架构落地，主要工作包括技术选型、组件协调/处理机制具体实现，其中最重要的就是要架构验证。一个好的架构让程序员专注于业务功能代码实现，较少涉及技术类问题处理。因此，在架构具体实现前，必须要做一个最小模型进行验证。
7.遵循重构的原则和方法
在进行软件架构重构时，需要遵循一些基本原则和方法。例如，保持代码的简短性和易读性，提高代码的可理解性，降低修改成本；及时进行重构，特别是在添加新功能、修补错误和复审代码时；识别和消除代码中的“坏味道”，如重复的代码、过长的函数、过长的参数列等。
通过上述步骤，可以设计出清晰的软件架构，并在此基础上进行有效的重构。
